HumanNet v2:用于疾病研究的人类基因网络 X科研网

HumanNet v2:用于疾病研究的人类基因网络
人类基因网络已被证明在疾病研究的许多方面都很有用,已经开发了许多基于网络的策略来产生关于基因 - 疾病 - 药物关联的假设。预测和组织与特定疾病最相关的基因的能力已被证明是特别重要的。我们之前通过使用贝叶斯统计框架整合各种类型的组学数据,开发了人类功能基因网络HumanNet,并展示了其检索疾病基因的能力。在这里,我们介绍HumanNet v2(http://www.inetbio.org/humannet),这是一个人类基因网络数据库,通过整合新数据类型,扩展数据源和改进网络推理算法进行更新。 HumanNet现在包含人类基因网络的层次结构,允许更灵活地将网络信息纳入研究。 HumanNet在对疾病相关基因集进行排序方面表现良好,具有最小的文献依赖性偏差。我们观察到,合并模式生物“蛋白质 - 蛋白质相互作用并未显着改善疾病基因预测,这表明许多疾病基因关联现在直接在人类衍生数据集中捕获。通过改进的交互式用户界面进行疾病网络分析,我们期待HumanNet将成为网络医学的有用资源。

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